Xenophobe — игра в жанре экшен. Цель каждого уровня — уничтожить всех пришельцев до того, как истечёт время обратного отсчёта. В некоторых комнатах обычно отображается процент заражения пришельцами и время, оставшееся до самоуничтожения в конце уровня (но с помощью кнопки рядом можно временно отключить обратный отсчёт). Уровни могут состоять из нескольких этажей, и игроки перемещаются между этажами с помощью лифтов. Игроки также могут подобрать более мощное оружие, чтобы помочь уничтожить пришельцев.